Jovan Stanković (4 de marzo de 1971 en Pirot, Yugoslavia), se incorporó a la disciplina del RCD Mallorca en la temporada 95-96, militando el equipo en segunda división y siendo el presidente del club el Doctor Bartolomé Beltrán. Al poco tiempo se hace dueño de la banda izquierda y se gana el cariño de la afición, siendo uno de los artífices del ascenso a primera división la temporada siguiente. Stankovic se convirtió en uno de los mejores extremos de la liga, destacando por su gran desborde, sus pases medidos a los delanteros y sus lanzamientos de falta.
Militando en el RCD Mallorca, y siendo entrenador del equipo Héctor Cúper disputó una final de la Copa del Rey, en la que erró un penalti que podría haber dado el título al RCD Mallorca, y una final de la Recopa. Además, de sus botas salió el último gol del Mallorca en el Lluís Sitjar contra el Celta de Vigo tras un lanzamiento de falta.
En el año 2000 abandonó las islas para fichar por el O. De Marsella de la mano de Javier Clemente. Al no disfrutar de titularidad y tras una temporada irregular regresó a la segunda división española para ayudar a sacar del infierno al Atlético de Madrid. En la temporada del ascenso cuajó una buena temporada pero en primera se desinfló y el Mallorca lo recuperó, pero para entonces ya no era el jugador de antaño y apenas goza de minutos. La temporada siguiente fichó por la UE LLeida, en el que fue su último año como profesional.
Jovan Stankovic abandonó el Mallorca en el mercado de invierno de la temporada 2000-2001, al ocupar plaza de extra-comunitario y tras reiterados problemas con las lesiones.