Título: Análisis de agrupamientos: aplicación a estudios de variabilidad molecular
Descripción: Este polimedia presenta las bases del análisis de agrupamientos, en concreto su aplicación a los estudios de variabilidad molecular. Además de explicar brevemente la utilidad del análisis de agrupamientos en este contexto, se detalla el porceso para llevarlo a cabo utilizando como ejemplo datos de marcadores moleculares dominantes. Por último, se indica la interpretación de los resultados obtenidos. Pérez De Castro, AM. (2011). Análisis de agrupamientos: aplicación a estudios de variabilidad molecular. hdl.handle.net/10251/9869
Descripción automática: En este video se explica el análisis de agrupamientos y su aplicación en el contexto de estudios de variabilidad molecular. Se busca enseñar al espectador cómo llevar a cabo y comprender este análisis utilizando datos moleculares. Inicialmente, se resalta la importancia del análisis de agrupamientos en la cuantificación de la variabilidad genética y el establecimiento de semejanza entre sujetos estudiados, para lo cual es preciso representar gráficamente grandes conjuntos de datos.
El proceso comienza con la obtención de una matriz de datos marcadores moleculares, seguido de la construcción de una matriz de distancia o similitud que compara los sujetos pareados según la presencia o ausencia de bandas específicas. Para calcular la similitud, se utilizan fórmulas como la de Nei o Dice, que se basan en la coincidencia de bandas entre individuos.
Una vez obtenida la matriz de similitud, se aplica un método de agrupamiento, en este caso UPGMA, que selecciona y agrupa las muestras más similares, recalculando la similitud con los demás individuos para formar nuevos grupos. Finalmente, los resultados se visualizan en un dendrograma que refleja la similitud entre las muestras. Se concluye recordando que existen diversos métodos de agrupamiento, adecuados para distintos tipos de datos y que se pueden consultar en la literatura especializada.
Autor/a: Pérez De Castro Ana María
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