100주년기념교회는 한국기독교100주년기념재단 소유의 양화진외국인선교사묘원(마포)과 한국기독교순교자기념관(용인), 이 양 성지가 사유화되는 것을 막고, 한국 기독교 100년의 신앙과 정신을 잇고, 한국 기독교 200년을 향한 바른 길닦이의 사명을 다하기 위해서 창립되었습니다.