Estos 7 videos han sido excelentes explicando el Chimera y dando referencias de la estructura de la proteína. Actualmente estoy analizando secuenciación masiva del género Achromobacter y en un subanálisis de una betalactamasa necesitaba visualizarla con Chimera. Estos videos me están ayudando mucho. Lo más importante en mi caso es comparar proteínas con Chimera y otro software, pero tengo la limitación de que no sé como pasar de un formato .FASTA o .xdna a .pdb para poder verlo en este programa. En todo caso, Gracias!! me ha sido muy útil tu trabajo.
@martinaborda667114 күн бұрын
Hola! cuales son las fuentes de energia y carbono de esta bacteria? excelente video
@topicosnucleicos449913 күн бұрын
La bacteria come opinas cuando está formado tumores, la planta se las produce. En condiciones de laboratorio la bacteria puede usar sales de amonio y sacarosa, no es delicada. Gracias por visitar el canal.
@marielm250318 күн бұрын
❤ el gracias rifa
@lorenzodebiasirobles304820 күн бұрын
excelente video! Saludos desde Argentina!
@melquicedecescalantevargas7126Ай бұрын
¡Excelente ilustración y explicación! Gracias.
@raulito12excape62Ай бұрын
Buen video siga así
@carlosdanieloropezarodrigu3973Ай бұрын
Está súper
@mariaguadalupevilchisvilch8689Ай бұрын
Gracias por subir videos nuevamente, espero que sigas subiendo más contenido porque es más que excelente.
@user-qb8fo4rx3jАй бұрын
Tu explicación es MUY ilustrativa; MUCHAS GRACIAS
@isaacramirez2405Ай бұрын
Muchas gracias por la información, la explicación y por su servicio a la comunidad estudiantil. Que se encuentre muy bien Saludos
@paularojas8730Ай бұрын
❤❤❤
@lizromero14032 ай бұрын
Muy bien explicado, muchas gracias! 💗
@anamartinez30612 ай бұрын
muchas gracias, me sirvió mucho.
@pepesanchwzespana82962 ай бұрын
Gran video!!
@user-js9xi8vw8q2 ай бұрын
falta mas detalles creo:c no logre entender
@RebecaManrique-nl4nz2 ай бұрын
Excente video!
@axelcatalan76103 ай бұрын
Como se realiza un analisis multilocus utilizando mega?
@topicosnucleicos44993 ай бұрын
Hola, en ese caso debes alinear cada locus de manera independiente, posteriormente unes los alineamientos, lo puedes hacer en: tcoffee.crg.eu/ Una vez que estén pegados usas MEGA para hacer la filogenia y boostrap como si fuera una sola secuencia
@gwensamayoa27313 ай бұрын
Hola! No tiene que ver con este video, pero vi otro de tus videos “identificación molecular de hongos con regiones ITS” y tu video me ayudó muchísimo!! Sin embargo, no se de donde puedo sacar más información de identificación molecular de hongos, si pudieras compartirme tus referencias estaría más que agradecida con usted, en verdad me ayudaría muchísimo
@topicosnucleicos44993 ай бұрын
Hola, perdón por no contestar pronto. En el video que menciones se incluyen citas bibliográficas. Puedes consultarlas. Además sugiero este artículo aunque sea de difusión de la ciencia: cienciaergosum.uaemex.mx/article/view/17956 La otra acción que puedes tomar es la de empezar a buscar información de ITS's de hongos que te interesen o con los que estés trabajando. en Google Scholar/Académico. Saludos.
@ricardosalasdezayas51433 ай бұрын
muchisimas gracias por compartir
@jhonjimmycondoriquilla43083 ай бұрын
Este tipo de explicaciones son las que te hacen amar la materia
@bellamar47623 ай бұрын
Buen día, una consulta. MEGA ofrece alguna forma de contar el número de mutaciones sinónimas y no sinónimas? En mi caso cuento con 100 secuencias de ADN y 1 secuencia de referencia de la proteína funcional. Tengo algunas dudas sobre como hallar dicha información.
@topicosnucleicos44993 ай бұрын
Hola, creo que como tal no te puede desplegar el número de mutaciones sinónimas (dS) y no sinónimas (dN), pero puedes realizar esto: 1.- Abrir archivo .meg 2.- Selection (es el ìcono que tiene signo "+") 3.- Codon-bases Z-test of Selection (te desplegará una matriz, es decir, te compara pares) Z-test es una prueba en la que partes de la hipótesis de que dS = dN la interpretación depende si aceptas o rechazas la hipótesis, y si la rechazas cual valor es mayor www.megasoftware.net/mega4/WebHelp/part_iv___evolutionary_analysis/tests_of_selection/synonymous_nonsynonymous_tests/hc_z_test_analysis_options.htm Mucho éxito!
@bellamar47623 ай бұрын
@@topicosnucleicos4499 muchas gracias!
@diegosepulveda71713 ай бұрын
Buenismo tus videos y la explicación bro! Voy en 4to año de biotecnología, mucho valor en tu canal exito hermano
@domingogarcia86133 ай бұрын
te amo
@semiramislozano19514 ай бұрын
como puedo identificar los polimorfismos no se subrayarlos ?
@topicosnucleicos44994 ай бұрын
Los polimorfismos son los cambios de nucleótidos que hay entre las secuencias. En MEGA los puedes notar a simple vista cuando hay columnas que tienen mas de un color, si los quieres marcar con un software debes usar otro programa, como BIOEDIT: bioedit.software.informer.com/
@amithaldana76944 ай бұрын
Gracias por tu tiempo y la explicacion de forma clara, por favor los videro sobre PCR
@ejgg1004 ай бұрын
excelente explicacion , muchas gracias, sigue haciendo mas videos.
@cbAngie615 ай бұрын
GRACIAS
@user-ef3ck6ew5j5 ай бұрын
Buen dia. soy nuevo en el tema. estoy tratando de apender sobre este tema del ITS.. gracias a tu video el proceso va en marcha------ ahpora me sale una duda, en algunos docuemntos o docuemtnos me sale el ITS 4... en que pocicion del operon se encuentra si solo se ha mencionado el its 1 y el 2 gracias te lo agradesco
@topicosnucleicos44995 ай бұрын
Hola. "ITS4" es el nombre de uno de los primers que se utilizan en la reacción de PCR. Ese primer se "pega" en LSU, es decir está cerca de la región ITS2. En el siguiente link viene un diagrama que ilustra esto que te digo y mucho más: www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1156903/
@user-et6sx2hb1k5 ай бұрын
Muchas Gracias.
@dannapaolahernandez24995 ай бұрын
muchas graciass, gran explicacion, todo super claro
@facundomuniz86655 ай бұрын
Gracias por la explicación. Una duda: ¿cómo logran que solo un fragmento se una por cada nano well?
@topicosnucleicos44995 ай бұрын
Que buena pregunta. No sé la respuesta. Supongo que por el espacio tan limitado solo puede hibridar una cadena antes del "bridge amplification"
@danieleduardogarciacastill91775 ай бұрын
increible trabajo. explicas muy bien temas complicados que incluso mis profes tienen dificultades
@danieleduardogarciacastill91775 ай бұрын
muy buen aporte
@ehecatl38305 ай бұрын
Felicidades además de explicar muy bien, su voz es muy clara y agradable
@mathz73795 ай бұрын
Hemos estado estudiando el uso de estas técnicas para el silenciamiento génico de patógenos en plantas, esta técnica se ve muy prometedora
@ehecatl38305 ай бұрын
Muy buenas sus explicaciones. Muchas gracias por su ayuda.
@karlabarron14546 ай бұрын
Hola, muchas gracias por tus videos en realidad son de mucha ayuda. Una duda, ¿cómo se diseña el plasmido? Es decir, como se integra cada elemento que lo conforma desde la inserción del gen, el gen de resistencia a diferentes antibióticos, la etiqueta etc. O ¿estos plasmidos son comerciales? y solo se manda integrar nuestra secuencia del gen de interés? Y si si es así, como eligió el mejor plasmido? ¡Gracias!
@topicosnucleicos44996 ай бұрын
Hola, gracias por tu pregunta. Históricamente los plásmidos se han hecho a partir de plásmidos/secuencias "wild type" ensambladas con el uso de enzimas de restricción y ligasas (en el canal tenemos videos de estas enzimas). Hay plásmidos que los pueden comprar en compañías pero es muy común que te los pasen otros laboratorios sin fines de lucro. Hay muchos mas que decir, a lo mejor se necesitan mas videos o_0
@mariaguadalupevilchisvilch86896 ай бұрын
Excelente 👌
@MariaMora-rk1wn6 ай бұрын
Excelentemente explicado
@stay_jc65616 ай бұрын
excelente material, muchas gracias por compartir.
@raulito12excape627 ай бұрын
Muchas gracias, excelente video
@Krissss8408 ай бұрын
Muy bien explicado, muchas gracias
@adalbertogrijalva69898 ай бұрын
Excelente y muy clara la explicación. Muchas gracias.
@joseoscar22358 ай бұрын
Excelente contenido sobre tópicos de biología molecular y genética. No se porque tiene tan pocos suscriptores y visitas. Yo lo recomiendo a mis alumnos y conocidos que les puede interesar y servir para revisar y aprender sobre los tópicos desarrollados. Gracias por compartir tus conocimientos.
@topicosnucleicos44998 ай бұрын
Muchas gracias por tus comentarios
@user-gm5pb9qo3j8 ай бұрын
Hola muy buena la explicacion, me gustaria saber como hacen para unir dos secuencias es decir en consenso de adn por el mega, se puede?
@topicosnucleicos44998 ай бұрын
Hola. No sé si te entendí bien, pero "unir dos secuencias" sería ensamblar. Si esa es tu pregunta se puede hacer en MEGA parcialmente, es decir, obtenemos los nucleótidos en común (alineados) y los extremos serán los nucleótidos no alineados. Algo parecido hacemos cuando hacemos secuenciación capilar: kzread.info/dash/bejne/ZqCs2sqMe8qwhKw.html
@emmanuelramirezbarron99068 ай бұрын
Wooooooooowwwwww muy interesante en verdad 😮
@mariaguadalupevilchisvilch86899 ай бұрын
Hola, ojalá pudieras subir videos relacionados con la preparación de medios de cultivo mas utilizados en el cultivo de tejidos vegetales.
@topicosnucleicos44999 ай бұрын
Hola. El medio de cultivo de tejidos vegetales mas usado es el Murashigue-Skoog (medio MS), otro menos popular es el Gamborg B5. En mi experiencia esos son los básicos, varía la cantidad de hormonas según la planta con la que estás trabajando pero eso es muy variable
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Estos 7 videos han sido excelentes explicando el Chimera y dando referencias de la estructura de la proteína. Actualmente estoy analizando secuenciación masiva del género Achromobacter y en un subanálisis de una betalactamasa necesitaba visualizarla con Chimera. Estos videos me están ayudando mucho. Lo más importante en mi caso es comparar proteínas con Chimera y otro software, pero tengo la limitación de que no sé como pasar de un formato .FASTA o .xdna a .pdb para poder verlo en este programa. En todo caso, Gracias!! me ha sido muy útil tu trabajo.
Hola! cuales son las fuentes de energia y carbono de esta bacteria? excelente video
La bacteria come opinas cuando está formado tumores, la planta se las produce. En condiciones de laboratorio la bacteria puede usar sales de amonio y sacarosa, no es delicada. Gracias por visitar el canal.
❤ el gracias rifa
excelente video! Saludos desde Argentina!
¡Excelente ilustración y explicación! Gracias.
Buen video siga así
Está súper
Gracias por subir videos nuevamente, espero que sigas subiendo más contenido porque es más que excelente.
Tu explicación es MUY ilustrativa; MUCHAS GRACIAS
Muchas gracias por la información, la explicación y por su servicio a la comunidad estudiantil. Que se encuentre muy bien Saludos
❤❤❤
Muy bien explicado, muchas gracias! 💗
muchas gracias, me sirvió mucho.
Gran video!!
falta mas detalles creo:c no logre entender
Excente video!
Como se realiza un analisis multilocus utilizando mega?
Hola, en ese caso debes alinear cada locus de manera independiente, posteriormente unes los alineamientos, lo puedes hacer en: tcoffee.crg.eu/ Una vez que estén pegados usas MEGA para hacer la filogenia y boostrap como si fuera una sola secuencia
Hola! No tiene que ver con este video, pero vi otro de tus videos “identificación molecular de hongos con regiones ITS” y tu video me ayudó muchísimo!! Sin embargo, no se de donde puedo sacar más información de identificación molecular de hongos, si pudieras compartirme tus referencias estaría más que agradecida con usted, en verdad me ayudaría muchísimo
Hola, perdón por no contestar pronto. En el video que menciones se incluyen citas bibliográficas. Puedes consultarlas. Además sugiero este artículo aunque sea de difusión de la ciencia: cienciaergosum.uaemex.mx/article/view/17956 La otra acción que puedes tomar es la de empezar a buscar información de ITS's de hongos que te interesen o con los que estés trabajando. en Google Scholar/Académico. Saludos.
muchisimas gracias por compartir
Este tipo de explicaciones son las que te hacen amar la materia
Buen día, una consulta. MEGA ofrece alguna forma de contar el número de mutaciones sinónimas y no sinónimas? En mi caso cuento con 100 secuencias de ADN y 1 secuencia de referencia de la proteína funcional. Tengo algunas dudas sobre como hallar dicha información.
Hola, creo que como tal no te puede desplegar el número de mutaciones sinónimas (dS) y no sinónimas (dN), pero puedes realizar esto: 1.- Abrir archivo .meg 2.- Selection (es el ìcono que tiene signo "+") 3.- Codon-bases Z-test of Selection (te desplegará una matriz, es decir, te compara pares) Z-test es una prueba en la que partes de la hipótesis de que dS = dN la interpretación depende si aceptas o rechazas la hipótesis, y si la rechazas cual valor es mayor www.megasoftware.net/mega4/WebHelp/part_iv___evolutionary_analysis/tests_of_selection/synonymous_nonsynonymous_tests/hc_z_test_analysis_options.htm Mucho éxito!
@@topicosnucleicos4499 muchas gracias!
Buenismo tus videos y la explicación bro! Voy en 4to año de biotecnología, mucho valor en tu canal exito hermano
te amo
como puedo identificar los polimorfismos no se subrayarlos ?
Los polimorfismos son los cambios de nucleótidos que hay entre las secuencias. En MEGA los puedes notar a simple vista cuando hay columnas que tienen mas de un color, si los quieres marcar con un software debes usar otro programa, como BIOEDIT: bioedit.software.informer.com/
Gracias por tu tiempo y la explicacion de forma clara, por favor los videro sobre PCR
excelente explicacion , muchas gracias, sigue haciendo mas videos.
GRACIAS
Buen dia. soy nuevo en el tema. estoy tratando de apender sobre este tema del ITS.. gracias a tu video el proceso va en marcha------ ahpora me sale una duda, en algunos docuemntos o docuemtnos me sale el ITS 4... en que pocicion del operon se encuentra si solo se ha mencionado el its 1 y el 2 gracias te lo agradesco
Hola. "ITS4" es el nombre de uno de los primers que se utilizan en la reacción de PCR. Ese primer se "pega" en LSU, es decir está cerca de la región ITS2. En el siguiente link viene un diagrama que ilustra esto que te digo y mucho más: www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1156903/
Muchas Gracias.
muchas graciass, gran explicacion, todo super claro
Gracias por la explicación. Una duda: ¿cómo logran que solo un fragmento se una por cada nano well?
Que buena pregunta. No sé la respuesta. Supongo que por el espacio tan limitado solo puede hibridar una cadena antes del "bridge amplification"
increible trabajo. explicas muy bien temas complicados que incluso mis profes tienen dificultades
muy buen aporte
Felicidades además de explicar muy bien, su voz es muy clara y agradable
Hemos estado estudiando el uso de estas técnicas para el silenciamiento génico de patógenos en plantas, esta técnica se ve muy prometedora
Muy buenas sus explicaciones. Muchas gracias por su ayuda.
Hola, muchas gracias por tus videos en realidad son de mucha ayuda. Una duda, ¿cómo se diseña el plasmido? Es decir, como se integra cada elemento que lo conforma desde la inserción del gen, el gen de resistencia a diferentes antibióticos, la etiqueta etc. O ¿estos plasmidos son comerciales? y solo se manda integrar nuestra secuencia del gen de interés? Y si si es así, como eligió el mejor plasmido? ¡Gracias!
Hola, gracias por tu pregunta. Históricamente los plásmidos se han hecho a partir de plásmidos/secuencias "wild type" ensambladas con el uso de enzimas de restricción y ligasas (en el canal tenemos videos de estas enzimas). Hay plásmidos que los pueden comprar en compañías pero es muy común que te los pasen otros laboratorios sin fines de lucro. Hay muchos mas que decir, a lo mejor se necesitan mas videos o_0
Excelente 👌
Excelentemente explicado
excelente material, muchas gracias por compartir.
Muchas gracias, excelente video
Muy bien explicado, muchas gracias
Excelente y muy clara la explicación. Muchas gracias.
Excelente contenido sobre tópicos de biología molecular y genética. No se porque tiene tan pocos suscriptores y visitas. Yo lo recomiendo a mis alumnos y conocidos que les puede interesar y servir para revisar y aprender sobre los tópicos desarrollados. Gracias por compartir tus conocimientos.
Muchas gracias por tus comentarios
Hola muy buena la explicacion, me gustaria saber como hacen para unir dos secuencias es decir en consenso de adn por el mega, se puede?
Hola. No sé si te entendí bien, pero "unir dos secuencias" sería ensamblar. Si esa es tu pregunta se puede hacer en MEGA parcialmente, es decir, obtenemos los nucleótidos en común (alineados) y los extremos serán los nucleótidos no alineados. Algo parecido hacemos cuando hacemos secuenciación capilar: kzread.info/dash/bejne/ZqCs2sqMe8qwhKw.html
Wooooooooowwwwww muy interesante en verdad 😮
Hola, ojalá pudieras subir videos relacionados con la preparación de medios de cultivo mas utilizados en el cultivo de tejidos vegetales.
Hola. El medio de cultivo de tejidos vegetales mas usado es el Murashigue-Skoog (medio MS), otro menos popular es el Gamborg B5. En mi experiencia esos son los básicos, varía la cantidad de hormonas según la planta con la que estás trabajando pero eso es muy variable
@@topicosnucleicos4499gracias 🙂
Excelente 👌 canal, muchas gracias.
Muy buen Video👌