Основная статья: Тайны Смолвиля (сезон 1)
После метеоритного дождя, обрушившегося на Смолвиль, бездетная пара (Джонатан и Марта Кент) находит в поле маленького мальчика и космический корабль. Джонатан и Марта Кент усыновляют ребёнка и дают ему имя Кларк. Довольно скоро мальчик начал проявлять необыкновенные способности: он оказался невероятно силён, быстр и неуязвим. Приёмные родители решили сохранить это в тайне.
Прошло двенадцать лет. Кларк стал здоровым деревенским парнем, успевавшим одновременно трудиться на ферме и хорошо учиться в школе. Он подружился с Питом Россом и Хлоей Салливан (редактором школьной газеты) и влюбился в Лану Лэнг (девушку, живущую по соседству), но так никому и не рассказал свой секрет. От друзей Кларк узнал, что после падения метеоритов в городе начали случаться странные вещи. Многие люди пострадали от излучения зеленых камней (криптонита) и стали фриками, проявляющими сверхъестественные способности. Многие начали использовать свои силы во зло другим, и Кларку пришлось бороться с ними. Кроме того, Кларк узнает, что зелёный криптонит, находящийся поблизости, не только лишает его сверхспособностей, но и вызывает нестерпимую боль.
Однажды Кларка на большой скорости сбил Лекс Лютор, сын миллиардера Лайонела Лютора. Автомобиль вместе с Кларком упал с моста в реку, но Кларк не пострадал и успел спасти Лекса. Между ними завязывается дружба. Лекс пытается отблагодарить семью Кентов, но отец Кларка не доверяет Люторам. «ЛюторКорп» проявляет интерес к исследованию метеоритов, но затем засекречивает все разработки. Лекс пытается разгадать тайну своего спасения.
Второй сезон
Основная статья: Тайны Смолвиля (сезон 2)
На Смолвиль обрушилась буря, и Лайонел Лютор теряет зрение. Пит находит в поле космический корабль Кларка, и Кларку приходится рассказать Питу свой секрет. Позже Кларк находит таинственные рисунки в пещерах индейцев. Благодаря учёному и миллиардеру Вёрджилу Свону Кларк узнает, что его настоящее имя - Кал-Эл, и он прибыл с планеты Криптон, которая была разрушена. Кларк также узнает, что свойства криптонита зависят от его цвета. Биологический отец Кларка, Джор-Эл, говорит ему, что он послан на Землю быть богом и призван завоевать эту планету.
Третий сезон
Основная статья: Тайны Смолвиля (сезон 3)
Кларк Кент (Том Уэллинг) чувствует себя виноватым в гибели ребёнка своих приёмных родителей. Надев кольцо с красным кристаллом криптонита, он отправляется в Метрополис, чтобы сбежать от прошлого. Однако он не до конца осознаёт, какими свойствами обладает красный кристалл. Постепенно Кларк становится агрессивным - он начинает грабить банки в Метрополисе.
Четвёртый сезон
Основная статья: Тайны Смолвиля (сезон 4)
Главный герой сериала Кларк Кент (Том Уэллинг) знакомится с Лоис Лейн (Эрика Дюранс), приехавшей в городок в надежде найти убийцу своей кузины Хлои Салливан. Вместе они едут в больницу, где вот уже несколько месяцев не может выйти из комы Джонатан (Джон Шнайдер). Кларк постепенно возвращается в семью. Кларк Кент после общения с Джор-Элом навсегда становится другим - отныне он Кал-Эл. На протяжении всего сезона герои разыскивают три таинственных камня, дарующие бесконечную власть. Лана возвращается из Парижа с новыми планами и новым бойфрендом. Джейсон приезжает из Парижа и уверяет Лану в необходимости продолжения их отношений. Джейсон и Лана продолжают скрывать их взаимоотношения от Кларка. Кларк вступает в школьную футбольную команду и немедленно занимает позицию защитника после того, как предыдущий защитник провоцирует драку с новым тренером Джейсоном. Тем временем Лана встречает мать Джейсона и видит яркое воспоминание происшествия в Париже, подтверждающий своё подозрение, что она была там, когда у Ланы появилась татуировка. Те кто инфицированы токсином, включая Кларка, Лану, Лекса и Джейсона, воображают, что их самые страшные страхи становятся правдой и затем впадают в кому.
Пятый сезон
Основная статья: Тайны Смолвиля (сезон 5)
Метеоритный дождь, обрушившийся на Смолвиль, приносит в город космический корабль. Его пилоты - мужчина и женщина - посланцы генерала Зода. Их цель - заключить Кларка Кента (Том Уэллинг) в космическую тюрьму под названием Фантомная Зона. Там он будет лишён своей силы и не сможет больше препятствовать планам злых сил.