بدأ حجر الأساس لجامعة كفر الشيخ عام 1957 بتأسيس المعهد العالي الزراعي بمدينة كفرالشيخ، وكان تابعاً لوزارة التعليم العالي، ثم تحول المعهد إلى كلية الزراعة عام 1969 وصارت تبعيتها لجامعة الإسكندرية، ثم انتقلت تبعيتها إلى جامعة طنطا بعد إنشاء جامعة طنطا عام 1973، ثم أنشأت كلية التربية عام 1977، ثم تأسس فرع لجامعة طنطا بمدينة كفرالشيخ عام 1983.
توالى إنشاء الكليات التابعة لجامعة طنطا عقب تأسيس فرع لجامعة طنطا بكفر الشيخ، فأنشأت كلية الطب البيطري عام 1985، وكليتي التجارة والهندسة عام 1990م، وكلية التربية النوعية عام 1988 (وكانت تتبع وزارة التعليم العالي حتى تحول تبعيتها إلى جامعة طنطا بموجب بالقرار الوزاري رقم (1187) لسنة (1991))، وكلية الآداب عام 1993، وكلية التربية الرياضية عام 1997، ثم صدر القرار الجمهوري رقم (129) لسنة (2006) بتحويل فرع جامعة طنطا الكائن بكفرالشيخ إلى جامعة جامعة كفر الشيخ ونقل تبعية الكليات إليها، وتوالى إفتتاح الكليات بجامعة كفرالشيخ حتى أصبحت تضم تسعة عشرة كلية وثلاث معاهد.
جامعة كفر الشيخ مؤسسة تعليمية حكومية، تسعى إلى إنتاج وتكامل وتطبيق ونشر المعرفة العلمية من خلال بناء ميزة تنافسية في مجالات التعليم، والبحوث، والخدمات المجتمعية والبيئة التي تساعد على تحقيق التنمية وتحسين جودة الحياة للمستفيدين في إطار من القيم الارتقائية.