Il link per Fiscozen: www.fiscozen.it/invitoENTROPY50A I video che ho citato che vi consiglio di recuperare: La verità sul Dogma Centrale della biologia molecolare: kzread.info/dash/bejne/fYp3ytF-YtfRd8Y.html La più grande prova della teoria dell'evoluzione: kzread.info/dash/bejne/doRt29ymfLO6nNo.html

Questo video é molto bello! Da tempo sono iscritto ai vari canali Entropy. Ho appena visto il video risposta che Caccia, biologo del canale "Polemica in Pillole", ha pubblicato oggi. Molto approfondito. Qua ci starebbe proprio una bella live di confronto! Apprezzo molto questo dibattito nel mondo dei biologi. Avendo suscitato un confronto tanto interessante, é giunto il momento di abbonarmi finalmente al canale di Giacomo! Ora mi appresto subito a farlo!

@stefanobi.7948

2 жыл бұрын

Appena abbonato tramite Twitch! Oh yeah!

@cinziamorani7982

2 жыл бұрын

Aggiungo il link al video di polemica in pillole kzread.info/dash/bejne/i2GNj9NpmsbVqNo.html

Se servisse tutto il DNA ogni minimo danneggiamento o errore o mutazione avrebbe conseguenze drastiche no?

@francescoghizzo

2 жыл бұрын

Secondo Matt Ridley, questo è esattamente il motivo per cui abbiamo due cromosomi dello stesso tipo e per il quale esiste la riproduzione sessuata

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

Esattamente. Questa cosa la spiegavo nella versione estesa del video. Poi mi è sembrato ridondante e l'ho tagliata.

@AC.198

2 жыл бұрын

@@francescoghizzo considerato che sono un laureando in giurisprudenza (che deriva le conoscenze nelle altre discipline solo tramite telefonetto) allora sono fiero del mio commento.

@marcss555

2 жыл бұрын

@@AC.198 io laureato in giuris spero di iscrivermi a biologia o fisica mentre lavoro ahah

@dariodipersia

2 жыл бұрын

Credo che il fatto che qualscosa non serva a nulla permette di avere "spazio" per mettere qualcosa che serve, cioè dal DNA inutile delle specie antenate il caso e l'evoluzione hanno potuto lavorarci sopra per dare qualcosa di utile alle specie discendenti.

Citavi la cipolla giustamente come esempio di "accumulo" di grandi quantità di DNA nella cellula, però il meccanismo che porta a questi enormi genomi nelle piante è molto diverso rispetto agli altri organismi. Nel nostro caso la trasposizione ha il ruolo predominante, nelle piante ci sono fenomeni di poliploidia, tra l'altro amplificati nella selezione delle cultivar a scopo agricolo.

scusi il DNA spazzatura è coinvolto in processi molto importanti come l epigenetica l omeogenetica regolatoria funzioni protettive ecc.. Non siamo più al DNA = proteine da un bel po' ormai. E inoltre non sapere una cosa non significa che sia inutile, la ricerca genetica molecolare è in continua evoluzione

Fosse stato considerato 15/20 anni fa quest’argomento sul DNA spazzatura ti avrei dato ragione ed è anche quello che fino a qualche anno fa si insegnava e veniva scritto sui libri di genetica all’università. In realtà la questione è di gran lunga più complessa e molte regioni che per gran parte del tempo pensavamo non servissero a nulla oggi sappiamo essere fondamentali in alcuni processi. In primis solo una picccola parte del materiale genetico trascritto viene effettivamente tradotto in proteina: questo capita sia a livello degli introni ma anche in moltissime regioni extrageniche che vengono trascritte e non tradotte. Esistono una marea di regioni utili per la produzione di RNA non codificanti, sia di lunghe dimensioni (lncRNA), sia di corte dimensioni (miRNA). Oggi sappiamo che ci sono circa 20/25 mila geni e che per ciascuno di essi sono presenti migliaia di miRNA regolatori, ognuno dei quali processato a partire da lunghe regioni di DNA trascritto. Per quanto riguarda le regioni ripetute che sono una grossa fetta di genoma, queste sotto forma di elementi trasponibili (LTR, line e sine) permettono la regolazioni di meccanismi ancora a noi sconosciuti e che anno dopo anno vengono portate alla luce (piccolo esempio, un recente studio a dimostrato che alcune sequenze trasponibili a seconda della posizione in cui si andavano ad inserire nel genoma delle cellule nervose, portavano a variazioni comportamentali nei topi). Io penso che col tempo la parte veramente inutile del nostro genoma sarà sempre meno.

So che la maggior parte di chi ti ascolta non sa molto di questi argomenti ma da biologo molecolare sono un po' deluso La parte sui trasposoni l' hai fatta troppo al volo Anche la parte sugli introni era da approfondire meglio, sarebbe stato il caso che spiegassi il loro ruolo, dire che non sono così utili è sminuente dato che pezzi di DNA privi di introni fanno fatica ad essere espressi e non vengono ben tagliati durante le fasi di splicing Studi recenti hanno dimostrato che anche una singola mutazione in regioni lontane dall' esone (in introni adiacenti a molte basi di distanza) possono comportare un alterata espressione dell' esone che è a valle e non di poco Bene gli esempi della macchina e del pedone ma così l' argomento viene trattato in modo fuorviante

@francomaffi9308

2 жыл бұрын

Tutto è perfettibile, ma immagina di dovere spiegare queste cose a dei profani che non ne sanno niente (io). Le metafore sono metafore, chiaramente avranno sempre delle parti dissonanti da un'accurata descrizione specialistica. L'alternativa è tacere, o fare un corso di laurea

@cristianbianchi6155

2 жыл бұрын

@@francomaffi9308 lo scopo del video è rispondere alla domanda, saltare passaggi chiave porta a spiegazioni semplici e sbagliate So che per te è meglio se ti dice meno cose ma così trai deduzioni sbagliate, meglio sapere di ignorare l' argomento piuttosto che pensare di aver capito Oggi è pieno di sapientoni che ripetono briciole di discorsi senza capire il complesso E bene dire a chi ne sa di meno che questo è l' 1% della risposta il resto lo si studia

Perché adesso non fare un bel confronto con il Caccia?

@Andreabont

2 жыл бұрын

Dubito lo farà...

Video stupendo, mi ha lasciato piacevolmente stupito. Non ho competenze nell'argomento se non un minino studiato al liceo, permettimi una domanda. Duplicare l'intero filamento di DNA non diventa uno spreco di risorse se gran parte del DNA è inutile? Se questo è corretto, l'evoluzione non dovrebbe premiare gli organismi che sono riusciti a "ottimizzare" questo procedimento, duplicando solo le parti essenziali/eliminando quelle non necessarie? Cosa sto tralasciando in questo ragionamento? Ti ringrazio moltissimo.

@killua_148

2 жыл бұрын

In realtà al minuto 12:15 ha risposto alla tua domanda. Ti consiglio di vedere il suo altro video sulla Rubisco

@gabriele21598

2 жыл бұрын

Una possibile risposta è che potrebbe esserci stata una selezione naturale verso organismi con genomi poco "densi" di sequenze codificanti proteine. Questo avrebbe permesso di rendere meno probabili mutazioni casuali in regioni importanti del DNA. Secondo me si potrebbe vedere l'estensione del DNA come frutto di un equilibrio di più forze: la tendenza dei trasposoni a riprodursi, la necessità di dover replicare il DNA in un tempo ragionevole per la specie e la tendenza a a favorire organismi che siamo meno suscettibili a mutazioni casuali.

@killua_148

2 жыл бұрын

@@gabriele21598 ma chi dice che un DNA meno denso diminuisca le probabilità di mutazione delle aree "importanti"?

@ChEfReN88

2 жыл бұрын

Il processo di Replicazione di Dna è un processo prettamente Biochimico. Ammesso che ci siano regioni di DNA inutili, per i complessi di replicazione riuscire a discriminarli semplicemente da una sequenza nucleotidica è pressocchè impossbiile.

@ildittatoresanitario2458

2 жыл бұрын

@@gabriele21598 A livello biologico sarebbe irrilevante: se la mutazione avviene in una sequenza codificante e genera una mutazione incompatibile o poco compatibile con la vita, la discendenza non sopravvive. Tuttavia è possibile che mitigazione di queste mutazioni sia energeticamente conveniente all'organismo, ovvero che complessivamente si spenda meno energia a duplicare molto DNA non codificante che non a sviluppare una discendenza incompatibile o meno compatibile con la vita in un dato ambiente: in questo caso la funzione sarebbe assolutamente definibile come tale, a dispetto di un'attività biologica "marginale" in sé. Spero di essere riuscito a spiegarmi.

In realtà dire che gli introni "servono solo a essere tagliati via" non rende giustizia alla loro utilità. Gli introni permettono: 1) lo splicing alternativo 2) l'exon shuffling 3) come hai già più o meno detto, aumentano la capacità di controllo dell'espressione genica, ad esempio tramite le sequenze regolatrici (però se non ci fossero introni, questa seppur piccola percentuale di sequenze regolatorie non potrebbe esserci) Questo significa nel primo caso che c'è maggiore efficenza del genoma (un singolo gene può codificare per prodotti multipli), nel secondo caso che abbiamo un ulteriore meccanismo (oltre alla duplicazione genica per esempio) per la creazione di nuovi geni Inoltre si sono evoluti per essere più lunghi degli esoni cosicché eventi mutazionali o di ricombinazione abbiano maggiore probabilità di cadere su essi, probabilmente senza conseguenze, piuttosto che negli esoni, dove il rischio di conseguenze anche gravi sarebbe maggiore Anche il fatto che gli introni siano una quasi esclusiva degli eucarioti un qualche indizio dovrebbe dartelo sul fatto che evidentemente comportano un vantaggio evolutivo alternativo rispetto a quello che comporterebbe la loro assenza Ti chiedo e chiedo a tutti dunque per cortesia di o mostrarmi dove e perché mi sto sbagliando, altrimenti secondo me una qualche correzione via commento o tramite l'aggiunta di un secondo video-pillola dovrebbe essere fatta (ma non voglio dirti quello che devi fare, ci mancherebbe, alla fine non sarebbe comunque disinformazione grave)

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

Peraltro nel punto 2 rientra anche il discorso dei trasposoni, dal momento che essi possono essere tra i veicoli dell'exon shuffling, ma non vorrei complicare il discorso più di quanto non sarei in grado di gestire In generale comunque ho visto diversi commenti dove suggerisci che la presenza di così tanto DNA inutile sia legata al fatto che è difficile liberarsene, eppure non c'è affatto consenso scientifico su questo, tant'è che il dibattito sugli early introns e late introns è ancora aperto (adottando il tuo punto di vista invece l'ipotesi degli early introns non avrebbe senso di esistere, dal momento che secondo questa la maggior parte dei procarioti sarebbe invece riuscita a disfarsi del DNA junk, cosa che tu invece ritieni troppo difficile)

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

Sto cercando di mantenermi breve per fornire più spunti che altro, ma il punto è: 1) se assumiamo l'ipotesi degli early introns la domanda diventa: come mai i procarioti (e non noi) sono riusciti a disfarsi degli introni? E perché l'hanno fatto e noi no? 2) se assumiamo l'ipotesi dei late introns invece: come mai gli eucarioti sono (quasi) gli unici che hanno conservato gli introni? E perché noi l'abbiamo fatto e gli altri no? Il dibattito è tutt'altro che chiuso

@armandodipalo5076

2 жыл бұрын

Negli introni si possono anche trovate le sequenze per i microRNA, i long non-coding RNA e i circularRna… Quindi tanto inutili non sono, anzi!!

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

@@armandodipalo5076 Credo che quelli vengano classificati come a parte dagli introni sai? Quindi più che altro si aggiungono alla quota di questi ultimi (23.5%), e da quello che so (ma dovrei verifìcare) fanno tipo il 13% del DNA, anche se c'è da considerare che sono sequenze mediamente o altamente ripetute. Sono da cell ora e non posso fare il fact checking di quello che sto scrivendo purtroppo, stasera verifico

Questo è un video da fuoriclasse. L'approccio statistico alla questione, stimando in quali porzioni del DNA il tasso di mutazioni è casuale e in quali porzioni invece è soggetto a selezione (positiva o negativa), è semplicemente geniale e pone una forte ipoteca su tutta la questione. Grazie per aver condiviso lo stato dell'arte di queste ricerche.

Alle superiori mi avevano spiegato che probabilmente, gli introni e il "DNA spazzatura" in generale, "diluiscono" il DNA che viene effettivamente trascritto, in modo tale che la probabilità che agenti esterni producano mutazioni sul DNA trascrivente sia ridotta. Quindi forse una funzione indiretta si può dire che ce l'abbia. Inoltre da quanto ricordo, i telomeri dei cromosomi non sono trascriventi ma servono comunque a proteggere le estremità dei cromosomi e nel tempo vengono erosi dalle varie divisioni cellulari che affrontano.

@stokdam

Жыл бұрын

La questione non è tanto l'utilità filamento in se, ma dell'informazione che codifica.

bel video, sono contento che tu abbia toccato le implicazioni "filosofiche" per cui ci da fastidio che il nostro DNA sia inutile. a me è piaciuta molto la frase di Dawkins in The Selfish Gene secondo cui anche i biologi spesso considerano il DNA uno strumento dell'organismo per riprodursi, quando invece è il contrario, l'intero organismo è letteralmente uno strumento costruito dal DNA per garantire la propria replicazione. penso che il fastidio derivi proprio dall'essere noi stessi lo strumento di qualcos'altro, di per giunta una molecola "stupida" la cui unica funzione è di replicare sè stessa. questo mette in dubbio la nostra autonomia e capacità di autodeterminazione come esseri coscienti.

@erinnik9767

Жыл бұрын

Quindi DNA come virus?

@barbarabianchi1719

Жыл бұрын

Solo chi avrebbe scarsa autostima giudicherebbe inaccettabile essere portatore del dopo. E` ovvio che siamo la creazione del DNA e non il contrario.

Mi sembra che parlare di utile o inutile sia piuttosto improprio se non anche scorretto. Seppure solo una piccola percentuale del DNA codifica, il resto fa comunque parte di una complicatissima struttura biomolecolare che ha una funzione di insieme. A meno che non si possa stabilire come e quanto DNA possa essere rimosso senza compromettere le sue funzionalità resta solo un discorso filosofico. Certo è che un vantaggio evolutivo è impossibile da prevedere e il fatto che si presenti a seguito di una mutazione che pure aumenta il DNA non codificante senza nessun fenotipo associato non ha nulla di strano. Il fatto che il DNA 'inutile' sia così presente in ogni vivente non può che far pensare che sia funzionale almeno a livello strutturale.

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

Oppure che in tutti gli esseri viventi ci sono meccanismi di duplicazione del DNA che non si riescono a bloccare del tutto.

Video molto bello e ben fatto. Non mi sembra però tu abbia citato l'importante ruolo degli RNA non codificanti (micro RNA, LincRNA, RNA circolari ecc), dunque sequenze geniche che vengono trascritte ma non tradotte in proteine ed hanno un ruolo fondamentale nel controllo della trascrizione genica (esempi famosi ed emblematici HOTTIP e HOTAIR che aiutano i complessi trascrizionali a legarsi al DNA). Seconda considerazione, sebbene è vero che comunque molta parte di DNA sembra "apparentemente inutile", avere un Background di DNA di fondo come riserva può essere molto importante evolutivamente perchè può essere fonte di nuovi geni che possono acquisire funzioni in futuro. UN esempio concreto è il caso caso degli "Pseudogeni", ovvero geni ancestrali o geni duplicati che hanno perso la loro funzione col tempo e che possono acquisire nuove funzioni. Recentemente si è dimostrato che possono essere responsabili di regolazioni in "trans" di geni simili. Non dobbiamo infatti considerare il DNA come un libro statico ma di un qualcosa di molto dinamico e che si rimodella col tempo(dovuto anche ai già da te citati trasposoni) e proprio questo rimodellamento è in parte motore dell'evoluzione o comunque di acquisizione di nuove funzioni. Infine, anche le parti "eterocromatiche" ovvero quelle spesso silenziate ed apparentemente senza funzione, in realtà hanno alcune funzioni. E' il caso per esempio delle regioni telomeriche (quelle poste all'estremità dei cromosomi) che vengono mangiucchiate un pò alla volta ad ogni ciclo cellulare ed impediscono che il DNA codificante sia implicato in questo processo di erosione. Dunque l'ipotesi che l'evoluzione dovrebbe rimuovere il DNA in eccesso è un'ipotesi sbagliata per due motivi: le regioni non codificanti non sono proprio inutili come sembrerebbe, si stanno scomprendo sempre più ruoli di queste regioni di questo DNA apparentemente spazzatura. E poi perchè avere una riserva di DNA non ancora sfruttato potrebbe in realtà essere un vantaggio. Inoltre esistono sistemi biologici, sviluppatisi durante l'evoluzione, estremamente complessi che coinvolgono la replicazione, la trascrizione, l'impacchettamento della cromatina, il controllo epigenetico, che rende veramente difficile, complicato rimuovere solo ed esclusivamente le regioni di DNA non necessarie per trarne un vantaggio energetico.

@armandodipalo5076

2 жыл бұрын

Vero, video ben fato ma un pochino superficiale. Oltre a non nominare gli rna non codificanti , anche dichiarare gli introni come quasi “inutili” mi sembra un azzardo. Spero che vada più a fondo nella questione nei prossimi video per non essere fuorviante.

È plausibile che il DNA "inutile" potrebbe avere anche una qualche funzione anche in qualche modo "cifrata" di ridondanza, integrity checking, forward error correction?

@colenpaben5135

2 жыл бұрын

Bravissimo! La Teoria del Informazione vedono il DNA e l'RNA esattamente in questo modo... Sono cioè metodi delle cellule per trasmettere informazioni e per trasmetterle la ridondanza è un fattore importante per prevenire errori di trasmissione.

@federicobaratelli347

2 жыл бұрын

Una teoria epigenetica sostiene che sia materiale di scrittura: i nostri comportamenti, abitudini, azioni, anche solo pensieri ed emozioni lo modificano, in modo da tenere traccia del proprio vissuto e trasmetterlo

@federicobaratelli347

2 жыл бұрын

Un'altra toria, del DNA codificate e non codificante, sostiene invece che la parte di cui non si conosce la funzione, serva per esprimere o meno i geni della parte codificante: a parità di geni, si possono avere diverse espressioni e attivazioni degli stessi

@brandon0099

2 жыл бұрын

sinceramente è già ridicolo considerare come "utile" o "inutile" un qualcosa (qualsiasi, non solo il DNA) della quale si disconosce una funzione prestabilita dall'osservatore in questione; non è che trovando almeno una funzione un qualcosa possa essere considerata "utile"

Provo a fare una ipotesi: un DNA senza ridondanza è più sensibile agli attacchi delle radiazioni ionizzatni e quindi avrebbe un tasso di mutazioni troppo alto (anche solo per radiazione naturale) perchè è più probabile che un raggio cosmico o un raggio gamma provochi una mutazione. Un DNA raggomitolato su se stesso con alta ridondanza invece "protegge" di più in quanto la radiazione è assorbita di più in segmenti che poi vengono scartati. Dunque la funzione del DNA ridondante sarebbe quella di assorbire radiazioni che vanno meno a intaccare le parti codificanti e quindi soggette a selezione naturale. Ci sono studi su questo filone?

Nella parte non codificante ci sarebbero anche gli interruttori genetici, circa il 2%, uno dei miracoli ingegneristici e delle parti più affascinanti dal DNA dal punto di vista evolutivo e dello sviluppo di un organismo. Consiglio vivamente il famoso libro ‘Infinite forme bellissime’ di Sean B.Carrol spero che ne parlerai approfonditamente. Sapere il modo con cui un organismo viene costruito è stata per me una grandissima sorpresa.

@barbarabianchi1719

Жыл бұрын

Paragonando il DNA all'umanita`, dovremmo seguire la logica di Hitler. Il tassello mancante, e` il recupero e riutilizzo del materiale di scarto. Come un motorino con una determinata potenza che, riassettato con potenziamento usando materiale di scarto, si presta ad una maggiore efficienza. Evoluzione non significa modifica del singolo pezzo, ma interazione tra le parti a livelli simbiotici. Per cui il punto NON e` lo scarto, ma come poter renderlo utile piuttosto che un problema da eliminare. Anche perche`, se fosse solo spazzatura, l'organismo l'avrebbe espulso.

Forse anche un po' sull'ondata di questa speranza voglio proporre una visione alternativa, qualcuno mi dica se ha senso(chimicamente parlando): è possibile che queste parti di DNA pur non contenendo informazioni utili, siano d'appoggio o in qualche modo necessarie affinché la copia avvenga correttamente? Faccio un paragone: secondo il ragionamento proposto anche un cameriere sarebbe inutile, perché non fa lui il piatto e allo stesso tempo non ha neanche la funzione di essere mangiato, nonostante ciò senza il cameriere i piatti non arriverebbero a destinazione.

Bel video, merita un like anche solo per la citazione di Guzzanti!

"Utile" e "inutile" sono categorie dell'Uomo, la Natura agisce diversamente. Anche un 92-98% di DNA "inutile", il cui scopo è magari solo quello di fare "massa" e protegge il 2% "utile" da alterazioni dannose per l'organismo, io lo trovo molto più che "utile", essenziale.

@askadia

2 жыл бұрын

E aggiungo una domanda: dato che ogni creatura vivente fa questa cosa con i trasposoni, è plausibile che i virus abbiano avuto origine da questo meccanismo?

Mi sorge una domanda... Potrebbe l'utilità del DNA spazzatura risiedere nel fatto che, essendo in rapporto molto maggiore al DNA utile, possa in qualche modo proteggere quest ultimo dalle mutazioni fungendo egli stesso da bersaglio? Statisticamente, ogni 100 mutazioni, solo 2 colpiscono DNA codificante, mentre le altre,pur mutando, non influiscono sul "prodotto finale"... È possibile?

@albertocalciolari4693

2 жыл бұрын

È la stessa domanda che mi sono posto anche io. Potrebbero fungere da freno al cambiamento, preservazione dello status quo. Come detto nel video le mutazioni non sono sempre vantaggiose. E' vero che sono soggette a selezione naturale ma sono a discapito dei singoli individui che le sviluppano.

@michelecasalino7640

2 жыл бұрын

@@albertocalciolari4693 esatto... Immagino debba stabilirsi una sorta di equilibrio dinamico tra vantaggi/svantaggi individuali e di gruppo.

Da studente di biologia posso dire che non esiste DNA "spazzatura" o "inutile", in quanto anche quello che non codifica per nulla ha in realtà funzioni di regolazione delle sequenze che invece esprimono informazioni. Posso fare un semplice paragone: immaginiamo che il nostro DNA sia come un programma del computer. In un programma le immagini e le cose che costituiscono la grafica sono decisamente meno rispetto al codice che serve per eseguire operazioni e per disporre le immagini nel modo e nell'ordine giusto. Ecco, il DNA "spazzatura" fa esattamente questo: dice quante copie di una proteina, enzima, recettore o altro la cellula debba produrre a seguito di un determinato stimolo dall'esterno per potere rispondere al meglio alle sollecitazioni. Non a caso poi mutazioni a sequenze specifiche, come gli Enhancer (incrementano il numero di copie di un gene) o ai silencer (diminuiscono il numero di copie di un gene) possono portare a diverse malattie tra cui (purtroppo) cancro. È poi vero che esistono sequenze che hanno ruolo di cuscinetto per subire mutazioni per evitare che si danneggino porzioni importanti; o ancora esistono sequenze apparentemente non codificanti che solo da qualche anno si è scoperto esprimessero piccole sequenze di RNA che hanno anch'esse ruoli regolatori nella cellula (micro RNA, snRNA, long non codingRNA per fare qualche esempio). Spero di avervi fatto incuriosire :)

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

No. Complessivamente tutto quello che stai dicendo sta nell'8% di cui parlo alla fine.

@eframpy

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife mi sento di dissentire purtroppo. Perché non stiamo considerando che mediante la bioinformatica si può comprendere come i geni mutino e con quale tasso, osservando come le variazioni positive o negative possano essere vantaggiose per l'organismo (perdita o acquisizione di funzione). La teoria del DNA spazzatura è essenzialmente superata da già qualche anno, dopo la scoperta dei micro RNA, i long ncRNA e diverse classi di RNA che sono necessari alla regolazione. Sul fatto che ogni gene ha delle zone di variabilità sono d'accordo, ma non lo sono quando si dice che vi sono zone inutili. Se così fosse (ci sono zone del tutto inutili) come si spiega il fatto che ogni d'elezione cromosomica porta nel 90% dei casi alla morte del soggetto per mancanza di funzioni apparentemente inutili?

Nel numero di aprile di le scienze c'era un articolo interessante sulle salamandre, in particolare Necturus lewisi, che hanno un genoma gigantesco pieno di trasposoni, caratteristica correlata a un'estrema lentezza nello sviluppo, cellule giganti, organi più semplici/distorti e incredibile capacità di rigenerazione (forse perché lo sviluppo lento porta a possedere a lungo molte più cellule staminali).

In merito è interessante il libro: “JUNK DNA”di Nessa Carey (2015).

Mi sembra che manchi una considerazione importante: tu dici che se la sequenza non conta allora quel pezzo di DNA è inutile. Ma questo non è detto. Ci sono parti del DNA che potrebbero avere funzioni strutturali, influenzando come la cromatina è organizzata dentro al nucleo, e che sono molto robuste rispetto a cambiamenti della sequenza, per cui possono tranquillamente accumularsi mutazioni senza che la selezione le tenga sotto controllo.

@simone8611

2 жыл бұрын

dubito che tali ipotesi non siano state vagliate, sono le prime che vengono cercate di solito. Il fatto poi che in quelle porzioni le mutazioni non debbano essere sotto controllo non è detto, chi dice che una sequenza non codificante mutando non lo diventi? tenere poi grosse porzioni strutturanti che allo stesso tempo devi controllare per evitare che si spostino, non mi sembra il massimo della funzionalità, è come se di una casa dovessimo controllare costantemente che le colonne portanti non creino problemi di altra natura.

Il DNA spazzatura non potrebbe essere utile per limitare l'impatto delle mutazioni sul DNA utile in modo che non ci siano selezioni troppo veloci?

Se il 98% del dna, nel caso muti, non fa danni, allora vuol dire che ha una enorme funzione di protezione dalle mutazioni negative. Quindi il 100 percento è utile. Immaginate esseri privi del dna ridondante. Ogni mutazione può essere fatale, quindi meno chanche di sopravvivenza e trasmettere il genoma.

@matteomastrodomenico1231

2 жыл бұрын

Questa é un'osservazione molto interessante

Una domanda da persona curiosa e con qualche base di biologia e genetica (ma per nulla esperto): Evolutivamente parlando non sarebbe conveniente "perdere" in qualche modo quei pezzi di DNA ? Anche perché presumo che la sintesi di acidi nucleici sia un processo abbastanza dispendioso sia di energie che di nutrienti !

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

Certo, quasi sicuramente, ma perdere non è facile ma evidentemente la pressione selettiva per gli individui che hanno meno DNA non è poi così forte.

@MrLuca998

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife effettivamente hai ragione ! Magari le energie consumate per quella porzione di DNA non son così tante in relazione del totale che consumiamo per il mantenimento del nostro corpo, quindi forse non apporta grandi modifiche alla "fitness" degli individui, grazie per la risposta !

@RobertoDAndrea

2 жыл бұрын

Bisogna mettersi nei panni del DNA. Lo "scopo" è quello di venire tramandato nelle cellule future. Nel senso che se sei tramandato continuerai a essere presente. Se fai danni, fallisci. Se fai qualcosa di utile a far si che la cellula sopravviva e si duplichi, migliorerai le probabilità di essere presente in futuro. Se non fai danni, semplicemente sarai presente in futuro perché ci sta il DNA utile che "lavora" per te. Se fai danni ma solo dopo che è avvenuta la riproduzione e dopo che alla prole sia stato dato tutto l'aiuto possibile, resterai nel materiale genetico perché la selezione naturale non avrà modo di eliminarti. Ogni gene, ogni pezzo di DNA sta lì e viene copiato e tradotto. Qualsiasi apparente "collaborazione" tra geni diversi è emergente come risultato della selezione naturale. Quindi non c'è nulla che lavori contro la persistenza di DNA inerte

@rdg7990

2 жыл бұрын

Non per forza, anzi: lo scopo di ciascun gene è di essere tramandato. Se un gene non fa nulla e si "attacca" a un altro che invece è di successo e si esplica, ha raggiunto pienamente il suo scopo senza interferire con la funzionalità della creatura. Win-win su entrambi i fronti. Oserei quasi dire che sia più normale che la maggior parte del DNA è inutile anziché il contrario.

@eframpy

2 жыл бұрын

Assolutamente no. Il fatto che gli organismi superiori possiedano questo DNA garantisce loro di essere, appunto, superiori. Cerca il mio commento e forse ti posso togliere qualche dubbio a riguardo. Ma molto in breve, non esiste DNA spazzatura, ma ogni singola coppia di basi ha un ruolo essenziale nella cellula e delezioni o aggiunte portano solo problemi

La domanda è: se c'è, ha una funzione? - Ipotesi sì: Allora qual è la funzione? Potrebbe essere che non siamo ancora in grado di comprenderlo perché neanche conosciamo la funzione che stiamo cercando. - ipotesi no: Se non ha funzione, allora perché c'è? Esistono "cose" solo come "effetti collaterali" di altre. Ad esempio il suono del battito del cuore è solo un effetto collaterale della sua attività? Due modi diversi di interpretare il mondo, la risposta non è scontata. Ma rimanendo con i piedi per terra, non si potrebbero fare degli esperimenti di tipo "funzionale" ovvero eliminare ciò che sembra abbia funzione e vedere cosa succede? Forse li hanno già fatti?

@truestopguardatruestop164

2 жыл бұрын

Si, non aspettarti che con questo metodo saprai se il nostro DNA sia riducibile di dimensioni.

Ciao Giacomo, ti sei mai chiesto il perché la natura abbia considerato "vantaggioso" far perdere i capelli, elemento che ci protegge, all'uomo?

Non è un po' arbitraria come posizione? Su un sistema complesso come questo mi pare più sensato analizzarne ogni parte e definire se questa ha una qualche funzione biologica o meno..? Alla fine i meccanismi regolativi a livello di trascrizione in biologia sono sempre un casino e spesso caso-specifici... Le parti non codificanti nel loro insieme possono essere determinanti per una corretta espressione della parte codificante, o sbaglio? Poi può benissimo non essere così per la maggior parte dei casi (analizzando le singole parti), ma dire che solo il 12% sia determinante mi pare un po' riduttivo, dal momento che parliamo di un sistema non ancora ben compreso. Boh, che dici? :)

Oddio, l'idea che parte del DNA sia inutile mi sta uccidendo, stanotte non riuscirò a dormire! Scherzo, la morte di una formica in Cina mi sconvolge di più. Forse è meglio raccontare i fatti così come sono e lasciar perdere la psicologia :) Grazie per la parte del video che narra i fatti.

Domanda da profano: sarebbe possibile "ripulire" un essere vivente dal dna inutile, lasciando solo quell'8% indispensabile? Nel caso fosse possibile, avrebbe senso farlo?

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

Su batteri e lieviti si è provato a fare. Sugli animali e le piante sarebbe un grosso casino

@carmelolagana8714

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife Grazie per la risposta 😊

@pietrosmusi2410

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife se hai degli articoli a riguardo, potresti condividerli? Sarebbe molto di aiuto, grazie in anticipo

@eframpy

2 жыл бұрын

Sarebbe più semplice a livello epigenetico, ma sugli organismi superiori sarebbe un'operazione inutile e che porterebbe ad un gran casino ahaha

@colenpaben5135

2 жыл бұрын

No... Il DNA e l'RNA secondo la Teoria del Informazione, non sono altro che metodi biologici per la trasmissione di informazione tra cellule. Una delle cose più importanti nella trasmissione di informazioni, che siano dati o altro, è la ridondanza senza di essa non ci sarebbe informazione ne prevenzione dagli errori di trasmissione. Insomma il DNA ridondante negli esseri superiori complessi non è affatto inutile...

Spiegazioni interessanti ed anche plausibili. Ma non ti sfiora nemmeno l'idea che ci sia anche la possibilità che la scienza non sia ancora arrivata a capire il significato del 90% del dna e che magari un giorno si scopriranno cose attualmente ancora impensabili? C'è un altro processo psicologico che ometti di dire, quello di pensare sempre che la scienza sia già arrivata a conoscere il mondo che ci circonda, mentre in realtà nei secoli è stata sempre smentita da nuove scoperte. Un po' meno presunzione non farebbe male agli studiosi! Comunque grazie per il video sempre molto interessante e ricco di spunti di riflessione.

Quindi noi potremmo usare il DNA di una forma di vita realmente vivente come strumento di memorizzazione temporanea di informazioni sfruttando i trasposoni come supporti di memorizzazione...

Sarebbe possibile "snellire" il dna? per esempio provando a riscrivere tutto il dna utile, impiantarlo in una cellula e vedere se questa continua con la riproduzione e la funzione o meno? Parlo di coltivare un gruppo di cellule con dna tagliato dalla "spazzatura". Perché a pensarci gli introni sono comunque parte del funzionamento della sintesi, quindi in teoria non dovrebbe funzionare nonostante non abbiano altro funzionamento dopo essere stati scritti (che comunque secondo me è una parte importante, alla fine stanno facendo da legame temporaneo durante la trascrizione o da barriera per permettere il "taglio" giusto, sennò il processo sarebbe diverso, non sarebbe più splicing alternativo ma sarebbe una sintesi senza altri passaggi), mentre i trasposoni e il dna connesso al loro blocco non vedo proprio come potrebbero interferire nel funzionamento di una cellula, quindi sarebbe possibile in via ipotetica creare una cellula senza questi.

@eframpy

2 жыл бұрын

Purtroppo non esiste DNA "inutile"

Giacomo da biotech adoro questi video, fanne altri sulla biologia molecolare, sono stra interessanti

Grande Giacomo anch'io uso fiscozen, mi sto trovando davvero bene con loro

Però le parti che servono a livello del centromero o dei telomeri probabilmente possono mutare casualmente ma comunque hanno un importante ruolo nella divisione cellulare

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

È vero, anche a questo non ci avevo pensato

E se quel DNA "inutile" servisse come "giubbotto antiproiettile" per proteggerci dalle mutazioni casuali? Se il DNA non codificante può essere mutato senza causare cambiamenti nell'individuo, magari la funzione è proprio quella di proteggere le parti codificanti, aumentando la quantità di DNA totale allora diminuisce la probabilità che venga mutato proprio quello codificante. (Possibile?)

cosa succederebbe se modificassimo il DNA di un embrione umano (subito dopo la fecondazione, prima della duplicazione cellulare) in modo da eliminare tutti gli introni e quindi tenendo solo l'8%-15% del DNA che trasmette effettivamente informazioni utili/necessarie?

Veramente interessante. È un piacere ascoltarti

Grazie Giacomo. Il DNA spazzatura è un argomento che seguo da molto tempo e avevo letto molti articoli scientifici. In un quarto d'ora tu mi hai aggiornato e molto bene. Gli ultimi dati che tu hai citato confermano una vecchia ipotesi espressa anche sui testi di Biologia che usavo a scuola come docente delle superiori. Volevo dare una mia risposta a Matteo Pauletto. La duplicazione del DNA è un processo fondamentale per tutti gli organismi viventi mono o pluricellulari. Se duplicare il DNA fosse un grande ostacolo, ci sarebbe una forte pressione a ridurre la quantità di nucleotidi da duplicare. Così non è. E tu lo spieghi molto bene. Se mi permetti Giacomo, avrei una domanda da porti per un tuo futuro intervento di aggiornamento. Nel corso evolutivo di quasi tutti gli esseri viventi, il DNA si porterebbe un enorme bagaglio di geni disattivati (arrivati in tanti modi: ad esempio con vettori virali o batterici) che sarebbero una riserva per le sfide del futuro. Cosa ne dici? Ciao e bravo!

Ma quindi, si è provato a eliminare quel 98%, a lasciare solo il 2%, e vedere che tutto funziona ugualmente?

Un video spiegone per capire bene cos'è, come funziona e che fa il dna? 🙏🏻

La funzionalità di porzioni latenti non vuol dire inutili. L'essere universo è proprio questo: riconoscersi.

Scusa ,se ti interrompo (il resto del video lo vedo dopo) ma questa cosa di "scartare parte dell' informazione trasmessa, è una cosa che succede anche nella trasmissione di immagini di suoni di dati, dei diabolici ingegneri hanno introdotto nelle sequenze sia di segnali analogici sia digitali dei segnali nel primo caso di sincronismo nel secondo caso di controllo che poi terminata la loro funzione smettono di fare parte dell' informazione , dai un occhiata al sistema pal dl della TV o al principio di funzionamento del televideo ,

Osservo che quel desiderio di trovare una funzione ovvero un senso alla natura non è un bias, ma è il motore psicologico della scienza, proprio perchè si postula che la natura sia razionale ( che sia sensata) si da il cominciare della scienza.

Accennare a Cuelo in una trattazione altamente scientifica è semplicemente... poesia!

L'introduzione mi ha ricordato il video sulla Rubisco

Io penso che la parte di DNA presente apposta per subire mutazioni senza modificare l'organismo sia molto utile, nonostante non codifichi informazioni. Non penso quindi di volerlo definire "inutile". Sarebbe come dire che il paraurti della macchina è inutile perché non ha alcun impatto sulla funzione del veicolo, cioè il muoversi.

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

Ma non è che la presenza di quel DNA assorbe le mutazioni del DNA funzionale. Quelle avvengono con la stessa frequenza, non è mica un parafulmine.

@mattiadiotti3184

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife avvengono con la stessa frequenza su ogni parte del DNA, quindi la probabilità che avvengano su una parte "utile" è inversamente proporzionale alla quantità di DNA "inutile". Ipoteticamente, se il DNA utile fosse solo lo 0.01%, non ci sarebbero praticamente mai mutazioni in quella parte (non che sia una cosa positiva, ma è solo per spiegare ciò che intendo)

@Aletpz45

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife però se come quantità fosse maggiore, lo sarebbe anche la probabilità che una mutazione cada in quel contesto?

@Laurelin70

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife Frequenza o probabilità? Guarda che in statistica non sono la stessa cosa...

DOMANDA: E se si provasse a "tagliare" le parti non codificanti del DNA di un organismo semplice, poi a farlo sviluppare? Cosa accadrebbe? Cosa verrebbe fuori?

@matteoginelli

2 жыл бұрын

Mycoplasma laboratorium!

@giuseppeguidad.a.3247

2 жыл бұрын

@@matteoginelli cioè? Scusa ma non sono un biologo

@matteoginelli

2 жыл бұрын

@@giuseppeguidad.a.3247 cerca pure su wikipedia, è il prodotto di un esperimento su quello che è chiamato Genoma Minimo =)

@giuseppeguidad.a.3247

2 жыл бұрын

@@matteoginelli Ok, grazie

Può la parte inutile di DNA fungere da protezione contro agenti mutageni? es. se ho un agente mutagene che può attaccare una porzione di DNA, ma il grosso di DNA è composto da zone inutili, allora questo agente mutagene avrà una maggiore probabilità di attaccare una zona inutile piuttosto che una utile. è mai stata testala la resistenza ad agenti mutageni delle varie specie, magari vegetali, in funzione della quantità di DNA inutile?

@eframpy

2 жыл бұрын

Esistono zone come gli esoni che in un gene hanno questo ruolo, ma comunque una mutazione che avviene in un qualsiasi altro punto anche se "inutile" porta comunque a problemi grossi nell'organismo. Cerca il mio commento al video così che forse ti possa togliere qualche dubbio

@Laurelin70

2 жыл бұрын

@@eframpy Quali problemi comporta una mutazione in una sequenza né codificante, né regolatrice? Ne risente la sintesi proteica, o la sua regolazione? Oppure influisce proprio sulla... non so, magari la "sopravvivenza" della molecola di DNA? O la sua resistenza alle mutazioni? Potresti spiegare in cosa consistono questi "problemi grossi"? (Non sono una biologa, tanto meno moleolare, quindi se potessi darmi una risposta in linguaggio "divulgatorio" ti sarei grata)

@eframpy

2 жыл бұрын

@@Laurelin70 immagini il DNA come una frase, con le sue proposizioni principali e subordinate, introdotte da virgole. Un gene è spesso così composto: un incipit che dà il via alla "frase", un'informazione principale ed una serie di regolazioni del gene stesso, che siano interne o esterne. Molto spesso sequenze apparentemente inutili sono il luogo di marcatura, come se venisse messo un post-it che dice "fermati qui", oppure "prosegui". Per fare un esempio, gli anticorpi sono formati da due parti, che possono generare milioni di combinazioni possibili. Queste combinazioni di formano perché durante la trascrizione del gene che porta alla formazione dell'anticorpo, possono avvenire una serie di eventi che portano alla formazione di una particolare combinazione dovuta proprio ai post-it, così da generare una proteina di difesa altamente specifica. Il concetto è ovviamente semplificato, ma spero di essere stato chiaro. Non esistono parti "inutili" del DNA. Il fatto che di una regione non si conosca il ruolo non vuol dire che sia inutile

Il dubbio è come mai l'evoluzione non premi organismi con un DNA più efficiente. Tutto questo materiale aggiuntivo, pur se biologicamente non dannoso, resta comunque una zavorra dato che la cellula deve spendere energia per mantenerlo, duplicarlo, trascriverlo, etc. Se si mantiene un vantaggio deve esserci. Il vantaggio non può essere che tutto quel materiale aggiuntivo sono pagine su cui domani l'abolizione potrebbe scrivere informazioni utili? Par passare da un batterio ad un organismo complesso devi avere a disposizione abbastanza DNA per aggiungere informazioni. Se la vita fosse efficente nel mantenere solo il DNA strettamente necessario all'organismo, la capacità evolutiva sarebbe fortemente limitata.

Quel 98 % ha una funzione specifica importantissima, senza quel 98 % non esisterebbero i film della Marvel

Nella ricerca di vita su altri pianeti, dovremmo aspettarci di trovare strutture come il DNA per definirla vita?

@cristiano02

2 жыл бұрын

Devono possedere una o più cellule per essere definiti vita con certezza, il DNA da solo non basta perché altrimenti anche i virus sarebbero vivi (non si sa ancora bene se lo siano veramente)

@Laurelin70

2 жыл бұрын

Devono avere un metabolismo, ovvero un insieme di reazioni coordinate che consentono a una struttura molecolare altamente organizzata di mantenere un ambiente interno costante, di accrescersi, scambiare materia, energia e informazioni con l'ambiente esterno e di produrre copie autoorganizzanti di se stessa. Il DNA è solo una tra le molecole biologiche, quella che permette appunto la riproduzione.

Poniamo che esista il gene che riguarda l'omosessualità (probabile). Verrebbero codificate proteine specifiche a seguito di meccanismi epigenetici che fanno esprimere quel gene?

Cosa ne pensi de Il serpente cosmico di Jeremy Narby e Breaking Open the Head di Daniel Pinchbeck? Magari ci potresti dedicare un video a riguardo.

Azzardo un parallelismo. Se il DNA è informazione che viene trasmessa, nelle telecomunicazioni avviene qualcosa di simile. Quando vogliamo trasmettere una informazione (as esempio una sequenza di 1 e 0 pensando al digitale) non ci limitiamo a trasmettere l'informazione "buona" ma la codifichiamo. La codifica ha vari scopi tra cui quello di far fronte agli errori di trasmissione e quindi permettere la correzione di questi errori o comunque diminuire gli errori sulla informazione "buona". All'atto pratico la codifica non fa che aumentare la lunghezza della sequenza di 1 e 0 che andremo a trasmettere. Maggiore è la lunghezza, maggiore è la ridondanza, maggiore è la probabilità che l'informazione "buona" ricevuta sia uguale a quella trasmessa.

98% mi sembra troppo ma il termine "inutile" mi sembra fuorviante, io userei "ridondante". La Teoria del Informazione vede l'RNA e il DNA come metodi biologici per trasmettere informazioni tra cellule. Non esiste informazione se non c'è ridondanza. Perché? Perché la ripetitività o ridondanza serve a garantire la trasmissione di Informazioni senza errori. Insomma senza la ridondanza le cellule non potrebbero trasmettere le informazioni per riprodursi e lavorare.

Il fatto che una porzione di codice venga scartato non significa che non serva, serve come separatore fra porzioni che altrimenti sarebbero attive troppo presto.

Il criterio della frequenza di mutazioni in analisi di genomics comparata non mi sembra privo di bias nel valutare "l'utilità" del DNA, in quanto si basa SOLO su quante mutazioni avvengono in determinate regioni, trascurando altri criteri di funzionalità che non risiedano nella sequenza, come funzioni strutturali ecc

Se è per questo basta anche solo pensare a DNA temporale , dato che tra la crescita e sviluppo dell'organismo le parti del DNA utilizzato sono diverse. Ho visto tutta la discussione dall'inizio e semplicemente si dimostra che ancora molto non è compreso. Alcune funzioni semplicemente si attivano solo in determinate condizioni, altre sono di salvaguardia da mutazioni, etc E se anche il DNA spazzatura funzionasse come "salvaguardia" avrebbe comunque la sua utilità.

Video molto interessante. Onestamente no, non ho pensato/sperato, a inizio video, che tutto il nostro DNA debba per forza avere un senso, per una serie di motivi: e' possibile che la vita, per come la conosciamo noi, sia solo un evoluzione di una continua replicazione molecolare. Anche la morte, sempre per come la conosciamo fino ad ora, sembrerebbe inutile. Un esempio: non sarebbe molto piu semplice per un embrione, creare una mano con le sole cellule necessarie, piuttosto che far morire quelle tra le dite, in modo da formare con le rimanenti cellule, appunto, le dita? Detto cio', riguardo la speifica parte del dna "inutile", avrei 2 domande: - e' stato provato, in laborato, a togliere tutto il dna inutile, magari, pezzo dopo pezzo, per vedere cosa succedeva al suo organismo? il parallelo sembra arduo ma e' esattamente quello che facevo da web designer, quando lavoravo sul codice html e css di un sito web, quando dovevo "pulirlo" dal codice non necessario. - e' possibile che invece tutto questo codice genetico in eccesso, sia un qualche tipo do protezione dai raggi UV e radiazioni? il filamento del dna e' "raggomitolato" al centro della cellula: magari tutto quello filamento in eccesso, evoluzionisticamente parlando, serve a dare un ulteriore protezione alle parti invece utili, protette dal "gomitolo" attorno ad esse.

E cosa succederebbe se si "ripulisse" il DNA?

Uno dei video più belli del canale ...♥️una domanda :per parti inutili vuol dire cHe se sostituite con altre non cambia niente??? Le mutazioni nelle parti inutile per non avere effetto posso essere cambiamenti qualsiasi o comunque ci sono dei vincoli????

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

A meno che casualmente non compaia una sequenza utile o dannosa non cambia praticamente niente.

@danielecidda4180

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife Secondo me bisogna stare attenti a confondere come inutili le parti che ammettono un alto tasso di mutazioni: il fatto che una sequenza sia sostituibile non significa che sia dispensabile. Tra le sequenze codificanti mi vengono in mente per esempio quelle per i fibrinopeptidi, le quali ammettono un elevato tasso di mutazioni per riuscire a produrre comunque prodotti funzionali, ma la loro assenza sarebbe disfunzionale. Lo stesso può valere per le sequenze non codificanti: come già suggeriva qualcuno i telomeri hanno sequenze indispensabili seppur la loro lunghezza possa variare, oppure le sequenze che distanziano un enhancer da un promotore, magari sono sostituibili, ma sono indispensabili, non inutili. Cito solo questo ma anche altri ho visto che hanno fornito obiezioni valide. Mi sembra che l'errore più grosso di questo video sia il confondere "sostituibile" con " inutile", altrimenti sotto a questo commento di @ingrobin avresti fornito una risposta chiarificatrice rispetto a ciò che aveva capito, che come ho spiegato è inesatto

Top il riferimento finale al profeta si Quelo

ciao! ci parli del perchè si invecchia? sarebbe molto interessante!

14:00 ecco la risposta! La stragrande maggioranza nel DNA non è inutile ma, incassando senza problemi le mutazioni, migliora la statistica e protegge statisticamente il DNA "importante". almeno credo di aver capito così

@EntropyforLife

2 жыл бұрын

Non funziona così. Non è un parafulmine. Le mutazioni avvengono con la stessa probabilità dall'altra parte.

@gasolone

2 жыл бұрын

@@EntropyforLife esatto, mi sono espresso male. Non intendo che la parte "inutile" siano più esposte alle mutazioni, ma semplicemente aumenta la "popolazione" e migliora la probabilità delle parti "buone" del DNA di scampare a mutazioni. Nella mia testa ho pensato che le mutazioni sono causate da agenti esterni (radiazioni etc). Non sono del campo🤐

@MrLuca998

2 жыл бұрын

@@gasolone intendi che per l'organismo possa essere una strategia evolutiva quella di avere tanto DNA inutile in modo da diluire i geni utili su cui potrebbero capitare mutazioni... Quindi è come se i geni utili su "nascondessero" in mezzo a una folla e fossero quindi statisticamente più difficili da colpire da mutazioni

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

@@gasolone sinceramente non mi pare tu abbia detto niente di inesatto, non a caso gli introni sono circa 10 volte (vado a memoria con il dato preciso, dovrebbe essere verificato) più estesi degli esoni di media

@Matt-wh6wj

2 жыл бұрын

@@gasolone credo che la probabilità sia la stessa per ogni gene, non è semplicemente "hai 100 geni sul totale che devono essere mutati", credo che ogni volta che venga trascritto un gene, esso abbia n% di mutare, e quindi se hai 100 geni utili e 900 inutili, non cambia nulla in confronto a quando ne hai 100 utili: ogni volta avrai l'n% che questi mutino.

Veramente dopo tutte le cose che ho imparato, in particolare da te, non credo più che tutto serva a qualcosa. Penso che tutto funzioni per puro culo, mentre le varie molecole provano a mettere insieme qualcosa e vedere poi se funziona.

Prima di tutto: interessantissimo video. Sarebbe stato molto utile un mese fa con l’ultima verifica di biologia e del quarto sulla trascrizione e traduzione😉 Comunque una domanda, che avevo anche quando ho studiato queste cose: il tasso di mutazione dici che è uguale per tutto il dna, quindi se ci sono 100 basi, 20 sono quelle fondamentali e muta sempre il 5% del dna, di quelle fondamentali ne muterà 1 e 4 non fondamentali, mentre se il dna fosse composto da solo 20 basi fondamentali con lo stesso tasso, sempre 1 verrebbe mutata, e quindi non capisco perché avere più basi è meglio. Dopo dici che le parti fondamentali subiscono meno mutazioni per la selezione naturale. Ora, da studente di futuro quinto scientifico e senza aver mai studiato a scuola nulla sulla selezione naturale nello specifico, dico: la selezione naturale agisce sulle popolazioni; le mutazioni sui singoli. Poi avranno più o meno probabilità di diffondersi, ma alla nascita non dovrebbe esserci un vantaggio dato solo dalla selezione naturale. Ripeto che conosco qualcosa solo dai tuoi video, quindi non mi considero certo un naturalista, e quindi potrei aver fatto diversi errori nelle mie domande, ma se mi chiarerai i dubbi ti sarò grato

@Pietro-qz5tm

2 жыл бұрын

Se il gene mutato è fondamentale per la vita allora un individuo con una mutazione che annulla la funzione non può nemmeno nascere. Per questo geni importanti mutano difficilmente nel senso che è raro osservarli mutati nella popolazione. (Sì, non tutte le fecondazioni diventano bambini.) La probabilità a priori che una base a caso cambi è uguale (immagino) ma la probabilità condizionata al fatto di vedere la mutazione in un individuo, vivo, non è la stessa e dipende dalla relazione tra la mutazione e la sopravvivenza dell'individuo. Allo stesso modo la propagazione nelle generazioni di una mutazione dipende dalla probabilità che l'individuo che la porta abbia prole quindi è influenzata da come la mutazione cambia la fitness.

Ti supplico leggi: non sto mischiando elettronica e biologia a caso perché l'informatica tratta qualsiasi tipo di informazione anche chimica e biologica. 3 miliardi di basi sarebbero 6 giga bit in un computer.( Ogni base ha quattro stati, un bit ha due stati, servono due bit per esprimere lo stato di una base 00 10 01 11 sicuramente lo sai) a ciò si deve aggiungere l'epigenetica. Un byte è fatto da 8 bit. 6giga bit diviso 8 è MENO di un gigabyte. Il telefono sul quale scrivo ha 6 gigabyte di RAM e 128 di storage. E non fa un cavolo. A ciò si deve aggiungere l'epigenetica. Si deve aggiungere il fatto che il DNA non è l'unica cosa dentro alla ovulo fecondato. C'è anche un po' di 'hardware' semplifichiamoci la vita e diciamo che tutta la struttura fisica di un ovulo fecondato è comunque espressa dentro al DNA. Se tu prendi l'8% di meno di un gigabyte non ti potrà mai bastare perché:. Meno di 1 GB + l'epigenetica + l'ovulo fisico. Però in un miliardo di lettere cioè un gigabyte : ci sta in italiano lo spazio per descrivere ogni singolo particolare anatomico anche includendo la ridondanza delle strutture? Non penso. Accio bisogna aggiungere le strutture innate del cervello che insegnano come imparare a parlare la musica camminare mangiare sesso morale etc.. si tratta di miliardi di neuroni ciascuno dei quali può avere miliardi di connessioni alcuni dei comportamenti di un essere umano hanno un sottostrato neuronale e non solo culturale quindi devono essere presenti nel DNA. a cio devi aggiungere come fare una cellula tutte le sue strutture (centinaia) tutte quante le molecole migliaia o decine di migliaia, poi tutte le proteine e le molecole che sono decine o centinaia di migliaia. Come interagiscono quando attivarle dove con quali altre. L'8% di meno di un GB? Meno di 80mega byte . Più epigenetica e ovulo? Ma che dici ?

@ludovicoprestipino851

2 жыл бұрын

Detto ciò Tu sei bravissimo. ti consiglio a tutte le persone interessate tra cui i miei studenti . ti sforzi di essere calmo o obiettivo . E soprattutto umile. e ti stimo. se puoi continua a fare questi video grazie.

@ludovicoprestipino851

2 жыл бұрын

Non ci vuole tecnologia fantascientifica per sostituire le sequenze che sembrano inutili con delle sequenze lunghe uguali ma fatte da noi casualmente. Oppure prendere le sequenze inutili di un organismo e sostituire e scambiare all'interno del genoma. È sicuramente l'ovulo nemmeno si dividerebbe se io dovessi fare una previsione.

@ludovicoprestipino851

2 жыл бұрын

Correzione un miliardo di lettere sarebbero 500 libri da 650 pagine quindi una descrizione della anatomia ci sta tranquillamente

@ludovicoprestipino851

2 жыл бұрын

C'è anche da dire che ogni elemento molecola ha un comportamento chimico particolare quindi parte delle informazioni non messe nel DNA potrebbero essere contenute nella struttura molecolare dei materiali che vengono fuori dell'organismo

@francescoghizzo

Жыл бұрын

​@@ludovicoprestipino851per risponderti con una metafora informatica, non servono così tanti geni per fare un essere umano, perché il codice genetico non è un blueprint, ma un codice che genera un essere umano in modo procedurale

Perché alla Citazione di Corrado Guizzanti c'è "Tavoletta"?

grandeee.. Quelo :D..citazione altissima

-Sai la storia che usiamo solo il 28% del DNA? -Con questa la usi solo il 2%. (cit.)

Brav0!

Il problema non è quello che desideriamo, è lo stridente contrasto con il resto della biologia. La natura è per sua stessa natura risparmiatrice e lo vediamo ovunque: organi che assolvono più funzioni, ormoni con effetti pleiotropici, recettori di membrana e messaggeri intracellulari che controllano più vie metaboliche... di inutile non c'è nulla, al limite c'è ridondanza. Davvero vogliamo credere che un organismo si tenga il 98% di DNA privo di funzione e spenda energia per duplicarlo? Non penso proprio. E' molto più probabile che assolva a funzioni ancora sconosciute. La considerazione si estende alla critica alla definizione "allargata" di funzione.

@Laurelin70

2 жыл бұрын

Di inutile non c'è nulla? Parlane con il coccige o con i denti del giudizio... L'evoluzione non è un qualche tipo di progettista: è un processo che lavora sul minimo indispensabile, che mantiene continuamente negli organismi strutture residuali, semplicemente perché gli individui che li hanno riescono comunque a riprodursi e quindi trasmettono quelle caratteristiche ai discendenti. Con questo modo di pensare all'evoluzione è molto difficile capire perché allora vengano mantenuti in giro nella popolazione umana alleli di malattie genetiche anche gravi: perché non spariscono, visto che decisamente non sono utili? Smettete la di pensare all'evoluzione come pensereste ad un ignegnere che cerca di migliorare il proprio progetto...

@ildittatoresanitario2458

2 жыл бұрын

@@Laurelin70 vorrei sapere dove ho scritto che l'evoluzione ha caratteristiche progettuali. Ciò premesso, faccio umilmente notare che è ben diverso parlare di un osso su oltre 200 (facciamo anche 3-5, d'accordo) o di 4 denti su 32 (che peraltro molti individui utilizzano comunque efficacemente per la masticazione) rispetto a bollare di inutilità l'80-98% di una struttura biologica.

@Laurelin70

2 жыл бұрын

@@ildittatoresanitario2458 E i residui di cinto pelvico dei cetacei? Quelli di zampe nei serpenti? E, come dicevo, gli alleli difettosi che provocano malattie ereditarie, anche mortali? Cos'hanno di utile? Non avrai detto esplicitamente che l'evoluzione funziona come un progettista, ma è una conseguenza implicita quando si afferma che "tutto in natura ha una funzione, siamo noi che non la conosciamo". Perché non è così che funziona l'evoluzione. La selezione naturale seleziona solo quei caratteri che NON IMPEDISCONO ad un individuo di riprodursi, e l'evoluzione della popolazione mantiene solo quei caratteri che permettono ad alcuni individui di AVERE PIÙ DISCENDENTI DEGLI ALTRI. Tutto il resto non conta, non c'è alcuno scopo, selezione ed evoluzione non sono "forze" esterne di qualche tipo, sono CONSEGUENZE di questa "discendenza maggiorata". Se un carattere è altamente disfunzionale ma non influisce sulla possibilità per l'individuo di riprodursi, verrà conservato, per quanto disfunzionale. Se, per qualche motivo del tutto indipendente, l'individuo portatore di quel carattere avrà più discendenti degli altri, il carattere disfunzionale nella generazione successiva sarà addirittura più diffuso. Se addirittura il carattere disfunzionale è ASSOCIATO in qualche modo ad una maggiore discendenza, quel carattere disfunzionale verrà conservato per più generazioni, si diffonderà sempre più e resterà nell'evoluzione della popolazione. Ma continuerà ad essere disfunzionale (o semplicemente, e più probabilmente, "non funzionale"), il fatto che continui ad esserci non significa che "serva a qualcosa".

@ildittatoresanitario2458

2 жыл бұрын

@@Laurelin70 Oltre ad assumere che io sia convinto che esista una progettualità nella natura, cosa non suffragata dalle mie affermazioni, continui a mancare il punto. Qui non stiamo parlando di qualche residuo, stiamo parlando del 98% di una struttura biologica. Vedi le altre strutture biologiche che conosci: ritieni più probabile che quel 98% sia del tutto inutile o che assolva a qualche funzione che per ora non conosciamo? Perché assumi che attribuisca questo a una progettualità, piuttosto che all'efficienza che si riscontra nella maggior parte dei sistemi biologici?

Wishful thinking → Speranza

Non sono riuscito ad ascoltare e a seguire granché da come mi sembrava di non capire

Qualcuno ha mai provato a tagliare il DNA non codificante e vedere se da quel genoma ripulito nasce per esempio una pianta perfettamente funzionante? O un batterio che magari è più semplice...

Non possono prendere il DNA di un organismo e togliere tutto il DNA inutile? Mi sembra il modo più ovvio per capire se è veramente inutile o ha comunque delle funzioni non legate alla codifica genetica.

Ed io che sono partito a pensare alla riduzione di complessità per creare i draghi

lavorando con codice informatico, non mi sorprende per niente.

Per gli ingegneri informatici: molte funzioni del DNA non sono altro che un spaghetti-code

mi domando se nel caso di retro virus il fatto di avere più dna del necessario sia in qualche modo rilevante

quindi prossimamente usciranno cipolle più leggere, togliendo tutto il DNA con la funzione di occupare spazio. Domanda: è possibile che una zona del DNA prima inutile diventi effettivamente vantaggiosa?

@stradedisardegna5867

2 жыл бұрын

Si, a volte capita. Per fare un esempio si pensa che la placenta si sia sviluppata dall'introduzione di un virus nel DNA di alcuni mammiferi. Non sembrano però casi molto frequenti. Diciamo che a volte l'evoluzione si arrangia con quello che trova...

Bisognerebbe aggiungere alla spazzatura genetica anche i retrovirus endogeni

@danielapenna4412

2 жыл бұрын

Che sono presenti sotto forma di trasposoni, non per forza trasponibili

ma il video "tutto il caos nel dna" lo farai mai?

Provo a riassumere quello che ho capito. La strategia 98/2 è stabile perché permette di minimizzare mutazioni su grandi porzioni di DNA, mantenendo costante il tasso di modifiche puntiformi. È come aumentare i bersagli per evitare che attacchi casuali dal basso valore atteso colpiscano parti essenziali, quindi virus che interromperebbero il flusso di codifica di una proteina hanno meno probabilità di verificarsi. Parallelamente un'altra strategia possibile sarebbe la ridondanza: i geni più importanti sono presenti in copie maggiori rispetto a sequenze che codificano proteine soppresse? So che nei grandi mammiferi è presente per diminuire il tasso di incidenza di tumori, ma sarebbe interessante scoprire di più.

@alessandrobellettini378

2 жыл бұрын

Se ho ben capito più DNA hai, più mutazioni subisci. Se noi avessimo solo l'8% ei dna fondamentale, in noi umani avverrebbe solo l'8% delle mutazioni

Io vorrei vedere il video su tutte le parti diverse del DNA. O tutto il caos del DNA

Risposta a chi argomenta che la parte inutile del DNA sia un parafulmine in grado di protegge la parte utile da mutazioni: La probabilità DELLA SINGOLA LETTERA di mutare è fissa ed uguale per tutte le lettere, indipendentemente da quante altre lettere ci siano.

@argon7711

2 жыл бұрын

Beh non c'è solo un tipo di mutazione, l'impatto di quelle che avvengono per agenti chimici o fisici esterni in teoria può essere diluito se il grosso del genoma non ha una funzione

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

Le probabilità che le conseguenze siano nefaste però cambiano se la singola letterina è presente in un esone o in DNA junk, e il DNA junk ha una probabilità di oltre il 90% maggiore che una delle letterine mutate sia la sua

@cristiano02

2 жыл бұрын

@@emanulevillafoglia3059 quello che intendeva dire chi ha scritto il commento era che la probabilità di mutazione delle singole lettere non cambia. Per esempio ho 1000 lettere e 10 mutazioni, oppure ho 100 lettere ed 1 mutazione. La probabilità di colpire dna utile è la stessa in entrambi i casi (poi non so se nella realtà sia effettivamente così, mi fido di quello che dite voi ahah)

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

@@cristiano02 Sì avevo capito, ma ti faccio un esempio: durante la meiosi tipicamente ciò che accade è avviene lo scambio di pezzi di DNA fra due cromatidi di cromosomi omologhi. Affinché ciò avvenga deve avvenire una rottura a doppio filamento in un punto casuale del cromosoma: se i cromosomi contenessero esclusivamente sequenze codificanti, ad ogni crossing over avverrebbe quasi al 100% il danneggiamento irreparabile di una di queste sequenze codificanti; se invece i cromosomi, come accade effettivamente, contengono solo un 1.5-2% di sequenze codificanti, la probabilità che tale rottura avvenga spezzando una sequenza codificante è appunto molto più bassa, proprio dell'1.5-2% probabilmente. Se non ti fila il mio ragionamento ti consiglio di cercare in un qualsiasi libro di testo di genetica/biologia/biologia molecolare o simili per esempio "exon shuffling" o "rimescolamento degli esoni". Troverai quasi sempre specificato che la presenza di introni favorisce la traslocazione degli esoni, perché tutti gli eventi più frequentemente implicati nella genesi di tale fenomeno possono far avvenire la/e rottura/e a doppio filamento necessaria/e in punti del genoma non codificanti, riducendo così la probabilità di mutazioni non sinonime e permettendo invece la creazione di nuovi geni nel tempo (il che è tendenzialmente positivo da un punto di vista evoluzionistico). E questo è solo un esempio specifico, ma altrettanto vale per esempio per agenti mutageni fisici/chimici/biologici ecc. Il vostro discorso vale, per quello che mi viene in mente, solamente nel caso delle mutazioni indotte da errori della DNA polimerasi, visto che in ogni caso dovrà "agire" su un intero genoma per sintetizzarlo, e quindi la probabilità che faccia errori in sequenze codificanti non è attutita dalla presenza di sequenze di DNA junk che facciano da cuscinetto

@emanulevillafoglia3059

2 жыл бұрын

@@cristiano02 Anche il fatto che gli introni siano mediamente molto più lunghi degli esoni non è un caso, puoi trovare facilmente in quasi tutti i libri testo anche questo

Ottimo lavoro come sempre 👍 La domanda che mi pongo è se si arriverà mai a poter curare una disabilità grave, compreso le malformazioni, agendo direttamente sul DNA sia pre che post, sempre se vi è una differenza tra le due. (Non ho studiato biologia/medicina ma è una speranza da caregivers familiare)

Sempre sul pezzo 🤩

Ho una domanda. Se il 98% del DNA è inutile allora le frasi che si dicevano in passato riguardo al fatto che tutti gli umani condividono il 98% di geni uguali (se non ricordo male, cioè attivi) è vera? Cioè, allora sono di più le differenze reciproche? Non ho capito questi punti.

@pacalm1741

2 жыл бұрын

E se il materiale inutile servisse per l'evoluzione o per farci morire prima?

Un pensiero "da papà" che mi è venuto vedendo il tuo video: sono contento che il 92-98% del DNA sia inutile. Le mutazioni spesso non sono compatibili con la vita/conducono a vite più difficili e quelle che conosciamo le associamo a malattie. O anche alle radiazioni solari o altre che bombardano le nostre cellule. Il nostro DNA ci fornisce invece uno scudo contro la mutazione. In qualche modo la specie si preserva rendendo gli individui di generazioni successive meno soggetti a mutazioni. Non ho capito se il fatto di avere questo DNA così lungo possa invece portare a inefficienze sia energetiche o altre. Magari replicare cellule e proteine che tra centinaia di migliaia di anni saranno lunghissime diventerà un problema

Ciao Giacomo il dna non racconta la nostra storia di discendenza ?

Peccato non aver nominato i non-coding RNA che ormai è noto che hanno funzioni quasi simil-proteiche e sono implicati in tantissimi processi fisiologici e patologici!

Il dna “inutile” non potrebbe funzionare semplicemente da codice di controllo in determinati precisi processi biologici? (Ah, però per me anche solo a livello d’impressione non stupisce affatto che dna di cipolla (più in generale vale per tutte le plantae ?) sia più corposo di quello animale… :-) Essendoci da milioni di anni più dell’homo sapiens non hanno preso strade evolutive più complesse (e quindi non mi stupirebbe anche qui a noi più “sconosciute”)?)

0:45 anche gli atomi che ci compongono sono "vuoti" per la stragrande maggioranza del volume.😢